1. почему в двух местах? 2. перед сборкой с внесёнными изменениями выполнили make distclean? если configure запущен с правильными параметрами, то в самом начале он напишет про safe mode отключен.
P.S. вы писали, что брали в cvs последнюю версию, однако в последней версии из cvs для сборки не safe парсера достаточно не добавлять что-то в параметры, а расскоментировать одну строку.
