Для начала посмотрим такую вешь: <?php include "blah-blah-blah.cgi" ?> Работает такая конструкция? Сдается мне, что оно честно вставит содержимое, но никак не результат выполнения. include() требует php'шного кода, которого в парсерной страничке нет - вот и получаем вставку текстогого файла.
Если уж на то пошло, смотри мануал на тему virtual().
Но делать так все равно не надо. Вставить всякие мелочи можно и самим парсером.
