Думаю вам имеет смысл ковырять свой auto.p на предмет глотания ошибок, возможно определенного типа (file.missing).
> ./parser3.cgi Parser/3.4.0 (compiled on i386-unknown-freebsd8.0)
>./parser3.cgi test.html begin : /home/moko/parser3/test.html(3:11): '/home/moko/parser3/test'.txt' read failed: No such file or directory (2), actual filename '/home/moko/parser3/test_27.txt' [file.missing]