если auto.p принадлежит не той группы, что процесс с parser cgi, то да, это всё имеет смысл. но по той же причине не считался бы и основной .html файл. но ведь он читается[раз выдаёт осмысленную ошибку], что мешает сделать у конфигурационного auto.p ту же группу, что и у всех файлов сайта?
диагноз: не нужно ничего пересобирать, и почему конкретно сейчас что-то ругается, несущественно.