Мог увеличиться объем выбираемых данных из БД. Также мог сократиться (по ошибке) объем памяти процесса.
Интересно, а вы переехав на 3.1.1 стали пользоваться ^memory:compact[] для устранения проблемы? Если нет, то причина не в том, о чем выше написано, а в чем-то другом, т.к. сам по себе парсер 3.1.1 весит поболее чем 3.0.7