У меня было на VirtualHost, но я попробовал и на cgi-bin. Не работает. Apache/2.0.45 Переменную REMOTE_USER мне удалось получить, только, если соответствующий .htaccess положить рядом с парсером. При этом пароль спрашивается, понятное дело, везде. Что-то с обработчиками во втором апаче намутили похоже.